In 1992 gaat de Stichting Grand Ballon aan de slag. Ze weet meteen 1500 fietsrecreanten naar de allereerste Limburgs Mooiste te lokken. Als startlocatie wordt het complex de Rouche in Heerlen gekozen.

Al in het tweede jaar wordt het evenement met medewerking van de Amstel Bierbrouwerij de Toerversie Amstel Gold Race. Gedurende de volgende 11 jaren staat deze klassieker met veel succes op Hemelvaartsdag op alle wielerkalenders. De enorme populariteit van de tocht en het steeds groeiende aantal deelnemers noopt de organisatoren uit te kijken naar een andere start- en finishlocatie. In 1995 wordt dat sportpark Kaldeborn in Heerlen. Al snel blijkt ook deze accommodatie te klein en kiest de organisatie in 2000 voor het evenemententerrein Megaland in Landgraaf.
In 2002 vragen gemeentebesturen de organisatie een andere datum voor het evenement te kiezen. Hemelvaartsdag is een piek in het toeristenseizoen en dat staat een grootschalige wielertocht in de weg.

De Hemelvaartsdag wordt verlaten en de wielerklassieker verhuist naar het eerste weekeinde na Pinksteren, een dal periode in het toeristenseizoen. Daarnaast wil Amstel de Toerversie Amstel Gold Race zelf gaan organiseren op de dag voorafgaand aan de wereldbekerwedstrijd.

Stichting Grand Ballon besluit de oorspronkelijke naam Limburgs Mooiste in eren te herstellen en het evenement op eigen kracht en met een duidelijke Limburgse signatuur te blijven organiseren. Daar waar de Toerversie Amstel Gold Race zoveel mogelijk het officiële parcours van de wereldbekerwedstrijd AGR volgt, kiest
Limburgs Mooiste voor een ieder jaar wisselende route. Het parcours is enorm uitdagend, toeristisch zeer aantrekkelijk en verkeersarm. Over het evenement is een typisch Limburgse saus gegoten.

De organisatievorm wordt steeds professioneler. De fietsclub Grand Ballon wordt van de Stichting losgekoppeld en de leden maken plaats voor professionals. De Stichting wordt gevormd uit twee organen: de Raad van Toezicht en de Raad van Bestuur. Dries Linssen, in 1991 initiatiefnemer van het evenement, blijft als directeur / bestuurder het organisatieteam aanvoeren.

In 2010 wordt Flexpoint hoofdsponsor van het evenement, en de naam omgedoopt in Flexpoint Limburgs Mooiste. De organisatie kiest ook voor een nieuwe start- en finishlocatie. Het business park Avantis in Heerlen wordt de uitvalsbasis: voldoende ruimte, vlak bij de snelwegen, niet in een woonwijk en dicht in de buurt van het fantastische fietsparadijs Zuid-Limburg.

In het jubileumjaar 2011 voegt de organisatie een wedstrijd toe aan het programma onder de naam Flexpoint Limburgs Mooiste Race. Om zes uur in de ochtend starten 50 licentiehouders, waaronder bekende namen als Erik Dekker en Steven Rooks, voor een wedstrijd over 135 km. Flexpoint Limburgs Mooiste onderscheidt zich door het gastvrije, Bourgondische en gezellige karakter. De organisatie is uitstekend en de medewerkers zijn vriendelijk, bekwaam en behulpzaam. Veiligheid en zorg voor het milieu staan hoog in het vaandel.